تنقل المصادر الصوفية كثيرا من كرامات الشاذلي التي تنطوي على مخالفات عقدية عدة بحسب علماء السلفيين، من ذلك ما ينقله الدكتور عبد الحليم محمود قائلا: «لما قدم المدينة زادها الله تشريفًا وتعظيمًا، وقف على باب الحرم من أول النهار إلى نصفه، عريان الرأس، حافي القدمين، يستأذن على رسول الله صلى الله عليه وسلم فسئل عن ذلك فقال: حتى يؤذن لي، فإن الله عز وجل يقول: (يا أيُّها الذينَ آمَنُوا لا تَدْخُلوا بيوتَ النبي إلا أن يؤذَنَ لكم) فسمع النداء من داخل الروضة الشريفة، على ساكنها أفضل الصلاة والسلام: يا علي، ادخل».
ومن ذلك قوله: “والله لقد تسألوني عن المسألة لا يكون لها جوابا فأرى الجواب مسطرا في الدواة والحصير والحائط، ويقول: “والله إنه لينزل علي المدد فأرى سريانه في الحوت في الماء والطائر في الهواء”.
شهيرة النجار